倘若重大动物疫情忽然爆发，那么会径直对畜牧业安全以及公共卫生构成威胁，而有效的应急管理是降低损失的关键所在。我国建设起了一套自预防至处置的完备应急体系，对各方责任以及具体举措予以了明确。
应急工作的核心方针
重大动物疫情应急工作依照二十四字方针而行，着重统一领导以及部门协作，这便要求各级政府创建快速反应机制，各部门于疫情出现之时能够快速联动，防止推诿扯皮。方针还凸显科技防治与依法处置的重要意义，确保每一项举措均有依据可循，与此同时仰仗专业力量实施精准防控，削减小盲目行动所引发的次生问题。
各级政府与部门的职责分工
县级以上人民政府当中的兽医主管部门，是应急工作具体的组织者，承担着监测的任务，负责进行调查，甚至要完成扑灭等核心工作。其他部委涵盖了卫生、公安以及财政等，要在各自所负责的领域给予支持，像物资层面的保障以及交通方面的管制得以实现。如此这般的分工，明确了责任的主体，避免出现管理的真空地带。兽医部门还要和国际口岸的检验检疫机构，保持信息的畅通无阻，防止疫情出现跨境传播的情况。
应急预案的制定与实施
国务院兽医主管部门于国家层面制定全国应急预案，并针对不同疫病制定具体方案。地方各级政府据此定制契合本地实际情形的预案，并上报备案。预案内容一应祥尽，涵盖疫情确认标准、分级响应机制以及具体处置流程。这保障了不论疫情于何处出现，皆能迅速寻觅到对应的操作指南，达成标准化处置。
监测网络与应急保障体系
用于发现疫情的眼睛是完善的监测网络，县级以上政府要加强基层动物防疫组织建设来确保其持续运行，且必须提前储备充足的如疫苗、药品、防护用品等应急物资，应急预备队的建立也极为关键，它是经过培训后能依据指挥部命令迅速投身疫情控制与扑灭工作进而提升处置效率的队伍。
疫情发生后的处置流程
出现疑似疫情情况后，县市级范围内的动物防疫机构，必须要在两个小时内展开上报动作。当确诊之后，兽医部门会马上着手划定疫点，还要划定疫区，以及划定受威胁区，并且会向政府提出建议，促使政府启动应急响应，同时启动封锁相关措施。针对疫区里面的易感动物，要实施紧急免疫操作，或者进行必要的扑杀处理。针对有可能被感染的人群，要开展监测工作。并且以上所有行动都需要在应急指挥部的统一领导之下才可以进行下去，以此来保证行动步调能够保持一致。
社会动员与后期恢复
社会力量参与疫情处置，乡镇组织要协助宣传防控知识，村居组织要协助收集疫情信息，疫区与毗邻地区政府合作工作，疫情结束后，经过潜伏期监测无新病例，经专业机构验收后解除封锁，政府把疫情处置相关经费含补偿费用纳入财政预算保障工作可持续。
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